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マラウイ都市部におけるPCV13導入後の肺炎球菌の代謝、病原性および抗菌薬耐性プロファイルの変化。
DOI:10.1038/s41467-023-43160-y
アブストラクト
肺炎球菌（Streptococcus pneumoniae）は、世界的に5歳未満の小児に大きな死亡率をもたらしている。多糖結合型ワクチン（PCV）は、ワクチン血清型の肺炎球菌感染症を減少させるのに非常に有効であるが、非ワクチン血清型の出現と持続的な鼻咽頭保菌がこの成功を脅かしている。われわれは、ワクチン接種後、適応した肺炎球菌遺伝子型が出現し、ワクチンから逃れる可能性があるという仮説を検討した。マラウイのブランタイヤでPCV13が導入されてから4～8年後に分離された2804株の肺炎球菌のゲノム配列を決定した。代謝コア遺伝子に基づいて肺炎球菌集団を「代謝遺伝子型」（MT）にクラスタリングするパイプラインを開発した。その結果、肺炎球菌の集団遺伝学的特徴として、異なる病原性と抗菌薬耐性（AMR）プロファイルを持つMTが出現することを示した。予備的なin vitroおよびマウス実験から、出現しつつあるMTの代表的な分離株は、増殖、溶血、上皮感染、およびマウスへのコロニー形成特性において異なることが明らかになった。この結果は、PCV13の導入に伴い、肺炎球菌の集団動態が変化したことを示唆している。
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