2019-2022年におけるパキスタンの歴史的保菌地域における野生ポリオウイルス1型の分子疫学とシフト。

背景：パキスタンは野生ポリオウイルス1型（WPV1）の常在国である。積極的な臨床および環境廃水サーベイランスと検査室調査は、ポリオ撲滅戦略の不可欠かつ主要な要素である。本研究は、2019年から2022年のパキスタンにおけるWPV1の現在の疫学を理解するために、主にウイルス学的データに焦点を当てている。

方法：急性弛緩性麻痺を報告された患者の便検体141037検体および排水検体3171検体について、細胞培養およびポリメラーゼ連鎖反応（PCR）を用いてポリオウイルスの検出試験を行った。WPV1の系統解析はMEGAとNextstrainを用いて行った。

結果：分離されたポリオウイルスは、複数の感染系統を持つ15の遺伝的クラスターに分類された。時空間的な傾向として、ポリオの発生率は大幅に減少しており、2019年には58地区で報告されたが、2022年にはわずか3地区で報告された。ペシャワール、クエッタ、カラチの歴史的リザーバーは、そこで長年活動していた野生ポリオウイルスの固有の感染連鎖を排除することに成功した。

結論：今回の調査結果は、パキスタンにおけるポリオウィルスの疫学が進化し、現在では南カザフスタン（KP）に限定されていることを補強するものである。ペシャワール、カラチ、クエッタの各ブロックでは、歴史的にポリオウイルスの貯蔵庫として知られていた場所からは、現在ポリオウイルスが検出されていない。2026年までにポリオウイルスの根絶を証明するためには、わずかに残っている感染系統を根絶するために、臨床および環境サーベイランスを強化する必要がある。