南アフリカ共和国ケープタウンのタイガーバーグ病院における乳児突然死症例におけるライノウイルスおよびヒト呼吸器合胞体ウイルスの遺伝子型解析。

乳児死亡率は依然として世界的な重大な問題です。乳児突然死症候群（SUDI）は世界中で報告されており、南アフリカ・ウェスタンケープ州では2024年に1,000出生当たり23.129の乳児死亡率が報告されています。ケープタウンのタイガーバーグ法医学解剖所で入院したSUDI症例では感染症が頻繁に確認されていますが、呼吸器ウイルスにおける分子多様性は十分に報告されていません。2015年から2019年に収集されたSUDI症例から採取された、既知のポリメラーゼ連鎖反応（PCR）陽性の気管および/または肺のサンプル162件を、ライノウイルスまたはヒト呼吸器合胞体ウイルス（RSV）の再検査を行いました。64件がライノウイルス陽性、15件がRSV陽性でした。陽性サンプルのうち5件は、サイクル閾値（Ct値）により決定されたPCRアッセイの増幅限界外であり、除外されました。さらに4件は増幅せず、残る70件は追加のシーケンス解析を実施しましたが、成功したシーケンスは53件のみでした。すべてのライノウイルス（A、B、C）の遺伝子型が同定され、RV-Aが最も多く、次いでRV-C、RV-Bの順でした。RSV-AとRSV-Bは同頻度で検出され、アミノ酸配列の比較により、20のアミノ酸重複と9の置換が確認され、2つのRSV-BA9遺伝子型が確認されました。本研究は、南アフリカにおけるSUDI症例における特定の呼吸器ウイルスに関する分子生物学的および系統学的特徴を報告しています。しかし、死後検体におけるウイルスの生存能力の急速な低下により、ウイルス遺伝子型と死亡原因または疾患の重症度との関連性を確立することはできませんでした。今後の前向き研究では、特定のウイルス株と臨床的疾患の重症度および死亡率との間の時間的関係と関連性を調査すべきです。