エジプトのナイルデルタにおけるウイルス監視のための廃水と臨床に基づく疫学。

適切に処理されていない廃水（ヒトウイルスを含む）が水環境や農業用水に放出されることは、公衆衛生上の重大な問題です。本研究では、都市下水と急性胃腸炎患児におけるヒトポリオマウイルス（HPyV）、パピローマウイルス（HPV）、肝炎Aウイルス（HAV）、および肝炎Eウイルス（HEV）の検出率を評価するため、SYBR Greenを基にしたリアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（qPCR）が適用されました。また、2年間の採水期間における下水中の季節分布と下水処理プロセスによるウイルス除去効率も評価されました。HPyV、HPV、HAV、HEVは、原下水においてそれぞれ68%、39.6%、42.4%、33.3%で検出され、冬季に最も高い発生率を示しました。処理済み下水サンプルでは、HPyV、HPV、HAV、HEVはそれぞれ21%、9.4%、18.7%、0%で検出されました。さらに、200の腹泻便サンプルにおいて、HPyV、HPV、HAV、およびHEVはそれぞれ72.5%、50%、13%、および5%で検出されました。HPyVは環境サンプルと臨床サンプルの両方でより高頻度に検出されました。これらのウイルスの原水、処理済み下水、および便サンプルにおける平均濃度は、それぞれ3.62×10 GC/ml、4.03×10 GC/ml、および4.05×10 GC/gでした。下水処理プロセスの効率を、流入時と流出時の平均濃度値に基づいて評価した結果、HPyV、HPV、HAV、HEVそれぞれで49.5%、47.9%、41.2%、100%の減少が観察されました。本研究は、特定の地域で循環するこれらのウイルスの流行病学を調査する追加ツールとして、環境モニタリングの有効性を示しました。