長読取シーケンスは、ムコ多糖症II型患者の遺伝子型スペクトルを拡大する。
DOI:10.1002/jimd.70055
アブストラクト
ムコ多糖症II型(MPS II)にみられる著しい遺伝的異質性は、現在の遺伝子検査に重大な課題をもたらしています。臨床的にMPS IIが疑われる92例の患者において、IDS変異を同定するため、長距離PCRと長読取シーケンス(LRS)を統合したMPS IIの包括的解析(CAMPS II)が確立されました。従来の遺伝子検査(マルチプレックスリガシオン依存性プローブ増幅(MLPA)とサンガーシーケンスを含む)との比較解析では、75%(69/92)の症例で一致した結果が得られ、25%(23/92)の症例で不一致の結果が観察されました。23の不一致症例のうち、CAMPS IIは18例の患者でIDS変異を新規に同定し、5例の患者で変異の検出精度を向上させました。CAMPS IIの病原性変異の診断率は82.6%(76/92)で、従来の方法(66.3%(61/92))よりも有意に高かったです。CAMPS IIは92例の患者において遺伝子型スペクトルを拡大し、そのうち79.3%(73/92)がSNV/Indel、15.2%(14/92)IDS/IDSP1逆位、2.2%(2/92)完全なIDS欠失、2.2%(2/92)大規模欠失/重複、および1.1%(1/92)IDS/IDSP1欠失が含まれていました。さらに、患者全体の14.1%(13/92)が新規変異を保有していました。複雑な再配置を有する15例の患者における接合部解析は、逆位や変換イベントに好発するホットスポット領域を同定しました。特に、本研究はCAMPS IIが多様なIDS変異の同定、診断率の向上、およびキャリア状態の特定において優れていることを強調しています。
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