インドにおけるリソソーム蓄積症のための国家バイオバンクの構築―研究と精密医療の進展に向けた一歩

背景：リソソーム蓄積症（LSDs）は70種類以上の多様な希少遺伝性代謝疾患群であり、特にインドのような遺伝的多様性と資源制約のある環境では、診断と治療に重大な課題をもたらす。 LSDsに関する臨床・ゲノムデータの中央集約型登録基盤の不足に対処するため、我々はインド初の政府支援による全国規模LSDsバイオバンクを設立した。本研究では、バイオバンクのインフラ、検体収集、保存手順、倫理的枠組み、ならびに研究・診断・患者ケアへの期待される影響について述べる。

方法：本研究では、17年間（2008-2025年）にわたり、530名の患者（無関係な個人526名と兄弟姉妹ペア2組）から得られた生物学的サンプルおよび臨床・遺伝学的データを対象とした。血液、血漿、尿沈渣からのゲノムDNAを含む生物学的サンプルは、酵素学的および遺伝学的検査のために処理された。臨床データ、酵素データ、遺伝学的データを含む生物学的サンプルデータを管理するため、中央集約型ウェブページが構築された。

結果：本LSDバイオバンクコホートは27疾患にまたがる8つのLSDサブグループを網羅し、最も頻度が高かったのはゴーシェ病（n＝70）、テイ・サックス病（n＝62）、ムコリポイドーシスII/III型（n＝44）、モルキオ病A型（n＝40）であった。 検体はインド15州から収集され、小児症例が大部分を占めた。詳細な表現型、酵素活性、ゲノムプロファイルが作成された。酵素活性測定では大半の症例で著しい活性低下が確認され、一部のLSDでは変動する残存活性が認められた。サンガー法、PCR-RFLP、標的遺伝子パネルシーケンス、全エクソームシーケンスを用いた遺伝子解析により原因変異が検出された。 特に、IDUA遺伝子におけるc.1469T＞C変異（ハーラー病の29.4％）、GALNS遺伝子におけるc.230 C＞G変異（モルキオ病A型の22.5％）、 GBA1遺伝子c.1448T＞C（ゴーシェ病の56％）、HEXA遺伝子c.1385C＞Tおよびc.964G＞T（テイ・サックス病のそれぞれ11.3％および8.1％）が最も頻度の高い変異であった。 さらに複数の新規・家族内限定変異も同定され、LSDsの変異プロファイルが拡大された。結論：本研究は低・中所得国における希少疾患研究の拡張可能なモデルを示す。このリソースは、インド人集団に特化した遺伝子型-表現型相関研究、自然歴解析、将来の精密医療戦略の基盤を構築するものである。