タイ東部で発生したノロウイルスGII.3[P25]による集団下痢症。
アブストラクト
背景:下痢性疾患のセンチネル検査室サーベイランスにより、ノロウイルスはタイにおけるCOVID-19パンデミック期間中、人々の非細菌性胃腸炎の最も一般的な原因であることが判明した。2021年12月から2022年1月にかけてチャンタブリー県全域の病院で下痢と嘔吐を呈する患者が増加したことから、集団発生の原因と考えられるウイルス性病原体の同定が必要となった。
方法:2021年12月から2022年1月にかけて発生した患者93例(うち65例)の糞便サンプル(直腸スワブまたは便)を採取し、リアルタイムRT-PCR法によりウイルス感染のスクリーニングを行った。その後、ノロウイルスGII陽性検体を、部分ポリメラーゼおよびカプシド遺伝子の標的増幅および塩基配列決定により遺伝子型決定した。優勢株であるGII.3[P25]から全ゲノム配列決定を行った。
結果:ノロウイルスは、本研究でヒトの糞便検体から検出された最も一般的なウイルスであった。アウトブレイク検体65検体中39検体(60%)、非アウトブレイク検体28検体中3検体(10%)がノロウイルス・ジェノグループII陽性であった。1検体はロタウイルス陽性で、1検体はロタウイルスとノロウイルスのジェノグループIおよびIIとの同時感染を示した。ノロウイルスGII陽性39株中28株からVP1およびRdRp遺伝子の塩基配列の取得に成功し,デュアルタイピングに使用したところ,それぞれ25/28株(89.3%)がGII.3,24/28株(85.7%)がGII.P25であった.ノロウイルスGII.3[P25]は、この集団発生を引き起こした優勢株であった。本研究で得られたノロウイルスGII.3[P25]の全ゲノム配列は、タイで初めて報告されたものであり、2021年に中国で発見されたノロウイルスおよび2022年に米国で発見されたノロウイルスとそれぞれ98.62%および98.57%の類似性を有していた。さらに、本研究では、GII.21[P21]、GII.17[P17]、GII.3[P12]およびGII.4[P31]を含む複数の共循環ノロウイルス遺伝子型の存在を証明した。
結論:2021年12月にタイ東部で異常な下痢の集団発生が認められた。ノロウイルス株GII.3[P25]がアウトブレイクの原因であり、タイで初めて検出された。GII.3[P25]アウトブレイク中の陽性率は散発例(GII.4)の6倍であり、典型的には小児ではなく成人が主要感染者であった。