モロッコ東部における染色体異常に関する最初の報告:一塩基多型アレイを用いたde novo部分トリソミー13qの新規症例の同定。
アブストラクト
背景:染色体異常は、先天異常、知的障害、流産の主な原因である。これらの異常はヒトの罹患率や乳児死亡率に大きな影響を与えている。ここでは、モロッコ東部の住民にみられる染色体異常について初めて報告する。さらに、生後11日の女児において、末端欠失を伴うde novo部分トリソミー13qの新しい症例について述べる。
方法:2015年11月から2022年3月まで、染色体異常が臨床的に疑われたBRO Biobankの患者195例をウジュダ医学薬学部の遺伝学ユニットの細胞遺伝学研究室に紹介し、細胞遺伝学的研究を行った。核型分析は、標準的なRバンディング技術を用いて末梢血サンプルに対して行われた。一塩基多型(SNP)およびコピー数多型(CNV)を同定するために、イルミナSNPアレイを使用した。
結果:195症例のうち32症例(16.4%)に核型異常が認められ、そのうち12症例に数値異常が、20症例に構造異常が認められた。数値異常で最も多かったのはターナー症候群とダウン症候群で、次いでエドワード症候群、パタウ症候群、クラインフェルター症候群であった。構造異常については、転座が最も多く、次いで誘導体染色体、逆位、欠失、そして生後11日の女児で確認された13番染色体の付加であった。この付加の特徴をさらに明らかにするためにSNPアレイが行われ、13q14.3q34領域に58.8-MBの重複があり、13q34領域に1-MBの欠失があることが判明した。追跡調査による両親の染色体分析では、両親の核型は正常であり、この部分トリソミー13qはde novoであることが確認された。この13q染色体上の新規重複に関連する表現型を、これまでに報告されたものと比較したところ、13q部分トリソミー患者の表現型にはかなりのばらつきがあることが確認された。
結論:本研究は、東モロッコにおける染色体異常に関する最初の報告であり、部分トリソミー13qの表現型スペクトルを拡大し、遺伝子型-表現型相関をさらに確認した。さらに、これらの知見は、より良い遺伝子診断のためにモロッコでマイクロアレイ比較ゲノムハイブリダイゼーション技術を確立する必要性を正当化するものである。