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呼吸器合胞体ウイルスのゲノム進化動態と世界的循環パターン。
アブストラクト
呼吸器合胞体ウイルス(RSV)は、幼児の急性下気道感染症の主要な原因であり、世界的に乳幼児の死亡原因の第2位となっている。季節性インフルエンザのような呼吸器系ウイルスについては、世界的な循環が広く研究されており、最近ではSARS-CoV-2についても詳細に研究されているが、RSVゲノムの完全な世界的な複数年サンプリングが行われていないため、RSVの分子疫学に関する理解は限られている。ここでは、INFORM-RSV研究によるゲノムサーベイランスを活用し、系統力学的アプローチを適用して、淘汰と中立的疫学的プロセスがRSVの多様性をどのように形成するかを明らかにする。ウイルスゲノムの全塩基配列を用い、RSVAとRSVBにおける部位特異的な多様化選択の類似したパターンを示し、その系譜に非中立的な疫学的プロセスの痕跡を回復した。系統地理学的アプローチを用いて、RSVAとRSVBの世界的な伝播パターンを支配しているのは航空機による移動であり、その結果、国を超えてかなりの程度系統的に混合していることを証明した。この結果は、RSVゲノムサーベイランスが、RSVの世界的伝播の理解を大きく変える可能性があることを示している。