性差や性別を連続変数として扱うことで、がんの精密治療を向上させることができる。
アブストラクト
背景:がんのメカニズム、罹患率、生存率に存在する著しい性差と性差は、まだ臨床に影響を与えていない。その障壁の1つは、がんの表現型が男性か女性かという明確なカテゴリーに分離できないことである。その代わりに、この便利ではあるが作為的な二分法の中では、男性と女性のがんの表現型は非常に重複しており、女性に偏った極端なものと男性に偏った極端なものの間で変化する。したがって、性差や性別に特化した治療は非現実的であり、私たちのトランスレーショナル・ゴールは、標的となるパスウェイに対する性差や性別の様々な影響に治療を適応させることである。
方法:この障害を克服するため、我々は成人がん26種と小児がん4種のトランスクリプトーム8370の類似性をプロファイリングした。このトランスクリプトーム類似性マップにおいて観察された類似サンプルの性別に基づいて、患者の性別と性別を予測する事後確率を計算した。
結果:Transcriptomic Index(TI)値は事後確率から導出され、男性または女性のトランスクリプトームが局所的に濃縮された極を同定することができた。TIはトランスクリプトームを、性および性別に偏った、標的化可能な経路における患者特異的活性の測定にデコンボリューションすることをサポートした。TIは、細胞周期のシグナル伝達や免疫のような機構的表現型において、性と性別に偏った極端な領域を同定し、各患者の全トランスクリプトームを、連続的に変化する性と性別の表現型の軸上に正確に位置付けた。
結論:がんの種類、患者の性別、TI値から、新規かつ患者特異的なメカニズ ム識別が可能となり、精密がん治療計画の現実的な性別適応に利用できる。