パキスタン人コホートにおける進行性家族性肝内胆汁うっ滞症2型の小児における新規ABCB11遺伝子変異のスペクトル。

進行性家族性肝内胆汁うっ滞症(PFIC)は、胆汁分泌障害を伴う小児期のまれな疾患であり、重篤なそう痒、黄色便、時に肝脾腫を伴う。PFICは、ATP8B1、ABCB11、ABCB4、TJP2、NR1H4、SLC51A、USP53、KIF12、ZFYVE19、およびMYO5B遺伝子の変異によって引き起こされる。ABCB11の変異は、胆汁酸塩輸出ポンプ（BSEP）をコードするPFIC2につながる。ABCB11のさまざまな変異は異なる集団で報告されているが、血縁関係にあるパキスタンの集団ではデータがない。我々は、PFIC2表現型を持つ両親と血縁関係のないパキスタン人小児66人を対象に、ABCB11遺伝子のコードエクソンとその隣接領域の塩基配列を決定した。その結果、12個のホモ接合型、1個の複合ヘテロ接合型、7個のヘテロ接合型の計20個のABCB11の変異が同定された。これらの変異には、11のミスセンス、2つのフレームシフト、2つのナンセンス変異、5つのスプライシング変異が含まれる。7つのバリアントは新規の候補バリアントであり、民族的に一致した正常人の120本の染色体のいずれにも検出されなかった。インシリコ解析の結果、4つのホモ接合性ミスセンス変異は高い病原性スコアを有することが明らかになった。スプライシングバリアントのミニ遺伝子解析では、エクソンのスキップやエクソンの追加が見られた。このデータは、疾患バリアントゲノムデータベースへの有用な追加であり、将来的には診断アルゴリズムの構築に利用されるであろう。