非常にまれなNOTCH2変異とアラジール症候群の臨床的特徴との関連。
DOI:10.3390/genes15081034
アブストラクト
背景:アラジール症候群(ALGS)は、2つの遺伝子の変異によって引き起こされるまれな常染色体優性遺伝病である:Jagged Canonical Notch Ligand 1 ()とNotch Receptor 2 ()。表現型の多様性と多臓器の臨床症状を伴う不完全浸透性が特徴である。
方法:次世代シーケンサー(NGS)を用いて、胆汁うっ滞と肝障害を有する患者230人を対象に、肝疾患関連遺伝子のパネルを解析した。希少変異については、バイオインフォマティクスによる予測および病原性の分類を行った。
結果:10人の患者で11の希少バリアントが同定され、2つのバリアントは同じ患者に存在した。10個のバリアントは文献に記載されたことのないものであった。その結果、2つのnullバリアントのみを病原性バリアントとして分類することができたが、ほとんどのバリアントはミスセンスであり(11個中8個)、意義不明バリアント(USV)に分類された。ALGSが疑われた患者のうち、2人はヌルバリアントを、2人はバイオインフォマティクスにより病原性が予測されたバリアントを、1人は同義バリアントと糖鎖関連遺伝子のバリアントを、2人はPESTドメインで良性と予測されたバリアントを保有していた。
結論:今回の結果は、バリアントと関連する表現型に関する知識を深め、ALGSの遺伝子診断を改善することを可能にした。