北アフリカおよび西アフリカにおけるエコーウイルス11の最近の分子疫学により、西アフリカの急性弛緩性麻痺症例から組換え株が初めて同定された。
DOI:10.3390/v16111772
アブストラクト
エコーウイルス11は、近年多くのヨーロッパ諸国で新生児に敗血症を引き起こし、公衆衛生上の大きな懸念として浮上している。アフリカ、特に資源と診断能力が限られている西アフリカでは、散発的な症例しか報告されていない。西アフリカにおけるE11の最近の分子疫学をよりよく理解するために、2013年から2023年までのポリオの急性弛緩性麻痺および環境サーベイランスシステムを通じて分離された23のエコーウイルス11株の特徴を、ハイスループットシークエンシングを用いて明らかにした。我々のデータは、急性弛緩性麻痺症例からの組換え株を初めて同定したこと、また西アフリカにおけるエコーウイルス11の分子的特徴についてこれまでに初めて焦点を当てたものであることから、注目に値する。さらに、我々のデータは、エコーウイルス11が1970年(95%HPD範囲、1961-1979年)に分岐し、4つの異なるクレードに進化したことを示しており、ウイルスは西アフリカからヨーロッパに広がり、2017年頃にフランスでセネガルとギニアからの2つの導入が見られた。さらに、インシリコ解析により、新生児の新生児敗血症に関連するヨーロッパ株のVP1配列に4つの非保存的アミノ酸置換があり、エンテロウイルスの遺伝子型に向かってVP1タンパク質に保存されたアミノ酸モチーフがあることが明らかになった。我々のデータは、エコーウイルス11の疫学に関する新たな知見を提供するとともに、特にアフリカにおいて、新興または再興のエンテロウイルス種を迅速に同定するために、ポリオ以外のエンテロウイルスを対象とした特定のサーベイランスプログラムを実施する極めて重要な必要性を指摘している。