アブストラクト

アトピー性皮膚炎（AD）は、小児に蔓延するアレルギー性皮膚疾患であり、腸内細菌叢の不均衡と密接に関連している。これらの微生物の変化とその機能的意味を調べるために、我々は統合的メタプロテオミクス解析と宿主間相互作用解析を用いて、ADを発症したタイ人幼児の腸内細菌叢と真菌叢、およびヒトプロテオームのタンパク質発現、機能、相互作用を調べた。観察されたように、AD群では、プロバイオティクス種、例えば、や、は存在量が減少し、一方、主要な病原性細菌および真菌、例えば、や、は存在量が増加した。さらに、発現タンパク質の機能解析を行ったところ、AD群では、バクテリオームではストレス応答とDNA修復に、マイコバイオームではリボソーム生合成関連プロセスに濃縮され、活性酸素種（ROS）の増加、腸炎症、真菌増殖、微生物ディスバイオシスと関連する可能性が示唆された。さらに、ヒトプロテオームを組み込んだタンパク質間相互作用（PPI）ネットワーク解析により、ADに関連するストレスや免疫系プロセスに関連する10の特徴的なタンパク質が明らかになった。我々の知見は、タイの乳児のADに対する腸内微生物とヒト宿主との間の主要な生物種とシグネチャープロテインの機能の相互作用を示唆している。我々の知る限り、この研究は、乳幼児におけるADや他のアレルギー疾患と関連する細菌-マイコバイオーム-ヒト腸内細菌研究をモニタリングするための最初のフレームワークとなる。