重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）によって誘導される変異体特異的なtRNA由来断片：疾患転帰の鑑別における意義。

重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）の出現は、世界的な公衆衛生上の重大な課題となっており、その病因に関する多くの分子メカニズムは依然として解明されていない。小さな非コードRNAの中でも、tRNA由来RNA断片（tRF）は、ウイルス感染におけるその役割から注目を集めている。 我々は以前、SARS-CoV-2アルファ変異株に感染した患者の鼻咽頭スワブ（NPS）検体において、tRNAの5'末端由来のtRF（tRF5s）に有意な変化が認められることを報告した。 この研究を基に、2021年後半から2023年2月にかけて209検体のNPS検体を収集した。この検体コホートには、デルタ株またはオミクロン株（BA.1、BA.5、XBB.1.5）に感染した患者および陰性対照が含まれている。 本コホートにおいて5つのtRF5（tRF5-GlnCTG、tRF5-CysGCA、tRF5-ValCAC、tRF5-GlyCCC2、およびtRF5-GlyGCC）の発現を調査したところ、ウイルス変異株ごとに異なる誘導パターンが観察された。以前、アルファ変異株によって誘導されると報告したtRF5-ValCACは、それ以降の変異株では検出されなかった。 tRF5-GlnCTGは複数の変異株（アルファ、デルタ、およびBA.1）によって一貫して上昇したが、BA.5およびXBB.1.5では誘導が減少した。tRF5-GlyCCC2の誘導はBA.1の流行期までは観察されていなかったが、当初はBA.1またはBA.5に感染した小児集団で発生し、その後XBB.1.5に感染した小児および成人集団の両方で確認された。 続いて、これらのNPS検体中のサイトカイン／ケモカインをBio-plexを用いて測定した。その結果、いくつかのtRF5レベルがウイルスの遺伝子発現と相関していることが判明した。機能解析により、これらのtRF5が対応するSARS-CoV-2変異株の複製を調節していることが示唆された。要約すると、我々の知見は、ウイルス複製におけるそれらの機能的役割およびバイオマーカーとしての可能性に関する知見を提供するものである。