喘息における気道上皮の遺伝的アンカーを用いた、DNAメチル化が遺伝子発現に及ぼす因果関係のin silico推定。

発現量形質メチル化（eQTM）解析により、DNAメチル化（DNAm）と遺伝子発現との間に数多くの関連が同定されているが、こうした関連の根底にある因果経路については依然として十分に解明されていない。 一塩基多型（SNP）を遺伝的アンカーとして用いて、喘息を有する（n = 219）および喘息を有さない（n = 236）若年者の鼻上皮サンプルにおいて、シスおよびトランス関連におけるDNAmと遺伝子発現の間の潜在的な因果効果を調べた。 我々は、38,562組のeQTMペアに対する因果効果を推定するため、共同有意性検定に適応型ブートストラップ法を用い、DNAmが遺伝子発現に影響を与えるのか、あるいはその逆なのかを評価する因果媒介解析を実施した。73%のペアにおいて、DNAmは遺伝子発現の妥当な原因であることが示された。これらのeQTMペアに含まれる遺伝子は、免疫経路において有意に富み、喘息の表現型と関連していた。 我々は、肺組織の様々な細胞タイプにおける発現形質量座（eQTL）の知見、および上気道におけるeQTLおよびメチル化形質量座（meQTL）の知見を再現した。これらの結果は、DNAmが喘息の予防および治療における有望な標的であることを示唆している。